运用潜水泵前须先看说明书，不能搞错，长时间不在运用前还得把叶轮弄转，不然会因为长时间不必卡死而烧包。开泵前，吸入管和泵内须充溢液体。开泵后，叶轮高速旋转，其间的液体跟着叶片一起旋转，在离心的效果下，飞离叶轮向外射出，射出的液体在泵壳分散室内速度逐步变慢，压力逐步增加，然后从泵出口，排出管流出。此时，在叶片中心处因为液体被甩向周围而构成既没有空气又没有液体的真空低压区，液池中的液体在池面大气压的效果下，经吸入管流入泵内，液体就是这样接连不断地从液池中被抽吸上来又接连不断地从排出管流出。
二忌不安装漏电保护器:潜水泵工作在水中，容易漏电造成电能损失甚至引发触电事故。如果装有漏电保护器，只要潜水泵漏电值超过漏电保护器的动作电流值（一般不超过30 mA）， 漏电保护器就会切断潜水泵的电源。 三忌电源电压异常时开机:电压过高和过低都会使潜水泵温升过高，缩短使用寿命甚至烧毁潜水泵。农村由于低压供电线路比较 长，线路末端电压过低、始端电压过高是常有的事。因此，在使用潜水泵的过程中，操作者须观察电源电压值， 若低于额定电压10%以下，高于额定电压10%以上，或电流大于潜水泵额定电流的20%时，应立即停机，并避免电源电压异常时开机。
潜水泵内部泄漏:潜水泵发生漏水时，导致缘破坏、轴承浸水、报警系统报警，迫使机组停止运行。其主要原因:潜水泵的动密封(机械密封)或静密封(电缆密封、0型密封圈)损坏造成渗水，动力电缆或信号电缆破损造成渗水。各种报警信号如浸水、泄漏、湿度等报警停机；安装前，应检查各密封部件的质量；安装时各密封部件端面接触良好；在运行前检查电动机的相间和接地缘电阻以及各报警系统的传感元器件是否完好。运行过程中发生上述故障时，更换损坏的密封件和电缆并且烘干电机。对拆卸的密封件和电缆不得再使用。
有些密封不好的潜水泵长期浸泡在水中时，即使不使用，绝缘值也会逐渐下降，蕞终无法投用，甚至在比连续运转的潜污泵在水中的工作时间还短的时间内发生绝缘消失现象。因此潜水泵在吸水池内备用有时起不到备用的作用，如果条件许可，可以在池外干式备用，等运行中的某台潜水泵出现故障时，立即停机提升上来后，将备用泵再放下去。